Пока сложно. Даже скорее - никак. Дело в том, что сведения о наборах данных хранятся в репозитарии SDE. Т.е. это просто строки в определённой таблице. И т.к. эта таблица должна быть видна пользователю, который обращается в SDE, то он видит список всех наборов данных во всех базах.
Придётся подождать SDE 9.0. Там весь репозиторий SDE можно хранить в любой базе. И на каждую базу создавать свой сервис в операционке. Тогда будут видны только наборы данных из этой базы.
