Вы хотите чтобы у Вас данные лежали в другой базе данных на этом же SQL-server? Так в чём проблема? В документе же написано.
1. Создаёте новую базу в SQL-manager.
2. Даёте пользователю SDE права в этой базе - Create Table, Create SP. В некоторых случаях можно ещё дать Create View и Create Function.
3. Даёте соответствующие права пользователям. Если эти пользователи будут создавать или редактировать данные, то как минимум - Create Table, Create SP.
4. В ArcCatalog создаёте подключение к SDE, в котором указываете к какой базе подключаетесь. Загружаете данные. И работайте на здоровье. Можете убедиться в SQL-manager куда данные попадают физически.