Сударыня, не хочу показаться невежливым, но позволю себе дать один совет - дабы не терять время прочтите пару книжек про ГИС ;)
Там Вы узнаете что такое проекции и различные системы координат (это к ответу на Ваш первый вопрос - скорее всего у Вас данные в градусах и на фрейме не стоит проекция...например для листов 200 ки на Союз это скорее всего GK какой-нибудь зоны), а также много еще чего полезного...
Второй вопрос не понял совсем...
Второе: имеется точечное покрытие, когда я его открываю, оно имеет значок точки. Однако в Аркмап оно открывается в виде аннотаций!
Это как? Вы его первый раз куда "открываете" до того как "открываете" в AMap?
С Уважением,