В расширении КОЛЛЕКЦИЯ СКРИПТОВ есть функция SPLITTING BY A LINE, которая позволяет разрезать линейный или полигональный объект линией из другой темы.
http://www.dataplus.ru/Root/Scripts/FView.asp?ScriptID=49
Вообще, Надежда, если вы в чем-то не уверены - работайте с копиями Тем, чтобы не прошлось потом восстанавливать потерянные данные.