Тк не ясны детали что у Вас приключилось, в т ч что такое черный растр, то - общие рассуждения:
- если речь о черно-белом вместо цветного - то в зависимости от программы привязки - например, в Kenneth R. McVay'евском WARP'е- так там требуется 24 битное исходное цветное изобр., а 8-битное превр в ч/б.
-при наличии больших искажений и большом степенях полиномов иногда у меня получался почти "черный квадрат".
-если исходное изображение при регистрации (особенно, если ошибиться где-то) поворачивается где-то на 90 и более градусов - у меня иногда были случаи ухода "картинки из кадра", который получался черным.
Ну а проверить влияет ли сжатый или несжатый TIF на результат - если по-честному 
- можете ведь и сами...
