Про использование ГИС в геологии можно писать долго и занудно, на эту тему написано множество инструкций, статей и т.д. Так, например, кроме просто ввода карт геологического содержания, существуют различного рода приложения, прогнозирующие полезные ископаемые. Другие приложения, использующие распознавание образов, например. Могу подробнее.