Добрый день.
Просто не были включены слои исполнителем при экспорте в IFC, сразу не заметил. Поэтому при импорте в Pro тоже не включились.
Пришлось затратить время и посмотреть основы BIM моделирования. Объекты в BIM - моделировании (например дыра в стене под оконную раму) создаются не моделированием стены с нуля с отверстием, а комбинацией стены и параметрического элемента "Проём", делающего вырез. Тогда для изменения размера надо в следующий раз изменить только числа в параметрах. Некоторые элементы нашей конструкции делались кобинациями балок, стен и проёмов. В бесплатных вьюерах BIM\ IFC элемент типа "Проём" не виден и не идентифицируется курсором, виден только в таблице элементов. В переданном нам IFC при загрузке в ArcGIS Pro такой элемент виден как "лишний" каркас с прозрачными стенками, что вызвало вопрос к Исполнителю.
Убирается фильтром.