"База есть и слои в ней присутствуют" - это очень хорошо.
Я просил убедиться, что Вы действительно отключили ssl на админские операции в этой базе.
Для этого нужно попытаться создать новую базу. Её потом можно сразу удалить.
Если база создаётся именно при подключении по порту 29080, то с CouchDB всё хорошо.
Тогда ищите дальше.
Слой, который не отображается удалить.
Загруженный пакет можно переопубликовать прямо с портала.
Смотрите журналы Portal ArcGIS Server и статус задания публикации.
Журналы перед публикацией можно очистить и перевести в режим отладки.
https://dev.land.ua/ArcGIS/rest/services/System/PublishingTools/GPServer/jobs=номер_задачи
https://dev.land.ua/ArcGIS/rest/services/System/PublishingToolsEX/GPServer/jobs=номер_задачи
Сертификат на https://dev.land.ua/ валидный?