Вернёмся немного назад, к проблеме конвертации данных в kml. Что мы имеем. Первый раз проблема была замечена в ArcGIS 10.5.1. Затем также обнаружена в 10.6. В чем заключается проблема: один и тотже слой может сконвертировать, а может и не очень сконвертировать (линейный слой превратиться в линии по всему земному шару, точки упасть либо в 0,0, либо в 90, 90). Слои одни и те же. Проекция WGS84. Копнув глубже, а именно разколупав саму полученную kml'ку выяснили следующее: в "неправильном" файле kml, неправильно записывались координаты, т.е. (порядок точно не помню) долгота, широта и высота записаны в десятичном виде, но вместо точки (разделителя целой дробной части) записывается запятая, и далее отделение координат происходит запятой (132,14560,45,6846,0). Соответственно тут съезжает с катушек. Когда разделитель между целой и дробной частью точка, а отделение координат - запятая, то всё хорошо (132.14560,45.6846,0). Причина такого поведения конвертации - непонятна. Шейп один и тот же. Есть предположение, что эта ошибка конвертации лезет и из настроек фрейма данных. Если бы проблема была из-за региональных настроек в системе, то нормального результата не получал бы в принципе.