Было выявлено при попытке запустить модель из-под Runtime, она стопорнулась на калькуляторе полей, служба техподдержки ESRI ответила, что некоторые тулзы требуют установленого десктопа и соответствующей лицензии.
За ссылки спасибо, возможно пригодятся, хотя пока найдено более элегантное решение, тестируем