Это означает, что остановки находятся на ребрах, по которым не может пройти маршрут (из-за какого-то ограничения). Например, если точка остановки расположена на ребре, по которому запрещено движение.
Перейдите к участку карты с ребрами, на которых расположены остановки и используйте инструмент Network Identify на панели network analyst, чтобы посмотреть свойства ребра сети.
В настройках анализа можно указать, чтобы производилось замыкание (snapping) на следующих ближайших ребрах, если самое близкое ребро не может быть использовано в сетевом анализе. Это Свойства сетевого слоя
Маршрут (Route) - закладка Сетевые положения.
Здесь есть очень классное руководство вместе с данными - может помочь начать работу.
http://support.esri.com/en/knowledgebase/techarticles/detail/32890 . Рекомендую!