Система координат одна. Картографический сервис тоже один.
Одно приложение создано в менеджере - там правильный масштаб, второе - на его основе дописан свой код. Неправильный масштаб получается, если мы в Default.aspx добавляем свои элементы управления - в основном это кнопки. Код, связанный с ZoomToScale, конечно же не изменялся. Вот и стоит вопрос, что же может влиять на неправильное отображение?