ваши полигоны имеют огромную площадь. они больше 400 000 000 000 неизвестных единиц в поперечнике, а Extrusion вы ему делаетет по полю, в котором стаят значения от 1 до 20. естественно при таком соотношении визуально вытягивание просто невиднО.
как вариант в ArcScene зайдите View -> Scene Properties и там нажмите Calculate from extent. тогда вытягивание будет более заметно глазу.
а лучше изначальные полигоны перерисуйте в более реалистичном масштабе, оно так будет правильнее.
P.S. простите, совет давал с картинкой из версии 9.3, но и в 10 должна быть эта опция. поправьте меня, если не так.