Посмотреть общую инфу
Sdemon -o status -i <servicename>
Посмотреть, кто подключен
Sdemon -o info -I users -i <servicename> -p <sdepassword>
Убить все подключения к сервису
Sdemon -o kill -t all -i <servicename>
Остановить сервис
Sdemon -o shutdown -i <servicename> -p <sdepassword>
опция -N в конце позволяет пропустить верификацию (
http://resources.esri.com/help/9.3/geodatabase/pdf/admincmd.pdf). С паузами не работал, увы, не подскажу. :(