Если то же самое - то странно.
Я добавил этот свой скрипт в тулбокс, запускаю инструмент из аркмапа - экран обновляется, без каких-либо проблем. Работает нормально как "в процессе", так и нет.
Вы скрипт не модифицировали, не сделали его частью какого-нибудь другого скрипта? Может в этом проблема? Запускаете под админом?
Возможно это какой-то баг в comtypes, и не работает на конкретно вашей платформе. Всё-таки это ведь beta.
У меня Windows 7 64, вроде работает - ошибок нет и при запуске скрипта экран аркмапа мигает, перерисовывается. Может им на sourceforge отписать? Или можно Марку написать, который ту презентацию сделал - вдруг он сталкивался с подобным. Мы чуток пообщались - он нормальный камрад, я уверен, что проконсультирует вас.
А на C# не пробовали сделать программку? Обновит экран? В принципе могу скомпилировать под framework 2.0 и выложить готовый экзешник, чтоб вам не качать сотни мегабайт Visual Studio.