1. Через блокнот не советую, ибо удалять нужно не только ссылку, а полностью объект со всеми ссылками на него, а вы вряд ли это умеете. Порушите проект. Но вы можете воспользоваться
AvPath, пустые ссылки он кажет и можно поудалять. Да и кстати, ведь можно еще более просто - если при загрузке долго и упорно отменять все пустые темы, и потом сохранить проект, то заново их не спросят - они будут удалены ;)
2.
EditTools - flip.