Для начала надо проверить установлен ли вообще 32-разрядный .NET Framework.
см. также:
InstallDISK\Windows\ArcGIS_Server_DotNet_Edition\install.htm
InstallDISK\ArcGIS Server\Windows\ArcGIS_Server_DotNet_Edition\Documentation\install_guides\Server_dotnet\ArcGIS_Server.htm
InstallDISK\Windows\ArcGIS_Server_DotNet_Edition\Documentation\install_guides\Server_dotnet\Using_ArcGIS_Server_with_a_64-bit_processor.htm