В первую очередь нужно регулярно выполнять компрессию базы данных и анализировать классы объектов, которые часто редактируются.
direct connect более чувствителен к каналу связи, так как гоняет больше информации по сети, чем при подключении через SDE. Но при сети 100 Мб это уже не должно быть заметно.