LAL77, спасибо за ответ!
А Union не подойдет?
Подойдёт. Если из результата научиться выкидывать полигоны, которыми режем (их легко определить - у них значение "-1" в поле бывшего OBJECTID слоя с объектами). И почистить таблицу атрибутов, в ней много лишних полей. Наверняка есть какие-то инструменты для этого, поищу.
А я тот свой вариант попробовал сделать. Сначала Split, потом Merge, и в конце Spatial Join, чтобы приписать объекту номер полигона, в который он попадает. Работает всё это, конечно, гораздо медленнее чем ваш вариант с Union. Да и не понимаю пока, как в ModelBuilder соединить результат Split (Workspace) со входом Merge (набор слоёв).
---------
Чтобы было понятнее о чем идет речь, попробую пояснить на примере. Есть некоторый набор объектов, пусть это будут здания. И есть другой слой - планшеты, полигоны с названиями (номенклатурой). Планшеты не пересекаются, идут стык в стык. Надо разрезать домики границами планшетов и каждому получившемуся кусочку домика приписать номер планшета, в который он входит.