Для SOM, и MonitorSOC(9.3.1) возможно придется явно поменять пароль у сервиса.
А Вот для Webservices возможно придется проверить все опубликованные веб-приложения - зависит от настроек приложения.
В любом случае страшно быть не должно - можно же и старый пароль вернуть :)
И вообще, по-моему, проще Администратора заставить убрать политику для этих пользователей. А ещё лучше использовать не доменный аккаунт, а локальный, но его нужно будет контролировать на всех узлах ArcGIS Server.