Нет, по-определению.
Назначение набора классов заключается в том, чтобы гарантировать одинаковые пространственные привязки (системы координат, точность и пр.) между классами объектов, которые в него входят.
Пространственные привязки между наборами могут различаться, посему ни топология, ни сетевые наборы данных, не могут находиться вне набора данных. И классы объектов, участвующие в топологии, должны быть внутри одного набора.
http://support.esri.com/index.cfm?fa=knowledgebase.gisDictionary.popup&AppStyle=arcGIS91&popupTerm=feature_dataset
http://webhelp.esri.com/arcgisdesktop/9.3/index.cfm?TopicName=About_topology
topology rules are managed at the level of the topology and dataset, not for individual feature classes.