Ну задачу можно и снять, если надоело ждать.
Для начала посмотрите просто в файловой системе - появляются новые тайлы или нет. Как они выглядят - все пустые или есть и нормальные картинки. Может процесс и идет - просто серверу некогда перерисовывать проценты :).
Задачу построения можно запустить заново с параметром "Пересоздать пустые тайлы" (Recreate Empty Tiles). Не пугайтесь, что тайлы начнут создаваться не сразу - сначала будет долго работать процесс поиска чего не хватает.
Размер кэша зависит от экстента и количества уровней.
3.5 Гб - не так и много. Для примера - кэш снимка Ландсат на Нижегородскую область из 11 уровней от масштаба 1:6000000 до 1:25000 в формате PNG8 занимает 10.9Гб, состоит из 1446673 файлов в 3395 папках. Естественно, в jpg он будет гораздо меньше по размеру. Но не факт, что он будет занимать меньше места на диске.
Можете сильно сэкономить место на диске, если отформатируете раздел с маленьким размером кластера - 512 байт на сектор. Файлы в кэше маленькие и пространство будет использоваться оптимально. Этот раздел диска (или вообще отдельный диск) лучше не использовать для других задач.
Общие рекомендации при построении - не запускайте сразу построение всего кэша. Для начала создайте 1-2 верхних уровня. Огрехи могут сразу вылезти, например, если выбран не правильный экстент (бывает при некоторых проекциях), то будет много пустых тайлов, которые не нужны. На крупных масштабах, можно строить кэш не на всю территорию, а только нужными фрагментами. Можно и на всю, но по частям - зависит от потребностей.
Не запускайте процессов (number of instances) больше, чем у Вас есть доступных ядер на всех узлах сервера. Будет строиться не быстрее, а медленнее.
Если есть возможность - переходите на 9.3.1. Если сервис создать в новом оптимизированном формате (MSD-based map service), то кэш будет строиться гораздо быстрее.
http://webhelp.esri.com/arcgisserver/9.3.1/dotNet/map_service_perf_and_func.htm
После построения кэша обязательно в свойствах вев-сервера для этого виртуального каталога измените ошибку 404.
http://blogs.esri.com/Dev/blogs/arcgisserver/archive/2007/04/12/Configuring-your-server-to-display-a-_2200_Data-not-available_2200_-tile-for-empty-map-cache-areas.aspx
Клиент будет получать файл и не будет просить сервер рисовать, то чего не нужно.
Успехов