Если с гугла Earth, WGS, конечно. Координаты географические, проследите чтобы было "широта-долгота WGS" или в этом роде. Если вдруг другие широта-долгота (Пулково) окажутся, то это не особо принципиально. Разница там метров сто, потом уточните по факту. Важно, чтобы эта проекция "прилипла" к вашему файлу, для чего, загрузивши, выставьте её в карте (датафрейме), затем файл перепишите "с проекцией датафрейма". Или define projection для файла отдельно есть, по списку это не сложно. Создасться prj, aux, xml или еще что-то - вечно они формат меняют. С этими довесками грузите свой файл (шейп) куда угодно, он "сам себя окажет".
Вручную конечно, есть масса калькуляторов нынче, даже онлайн. Я не юзал, особо незачем, TatukGIS народ хвалит, раньше Blue Marble был знаменит. Формулы составлять в екселе? Замаетесь, но и это есть при желании упереться в алгебру.
Да и оси поменять, конечно. Анна на Гис-лаб вам правильно подсказала... У меня картинки отключены, я и не вижу таких подробностей :D