СК это система координат, а не проекция, соответственно никаких зон в ней быть не может. Вы наверно имели в виду проекцию UTM WGS84? Однако имея ArcMap совсем не обязательно при хранении задаваться конкретной проекцией, тем более зональной. Последние годы мы храним по возможности в географии (широта-долгота), и в общем-то щасливы, перепроецируя в нужные зоны по необходимости и желанию заказчика.
Длины отрезков "искажатся" никак не могут, пока вы храните. Они искажаются при публикации материалов в конкретной проекции, точнее, при измерениях по конкретной проекции они будут отличаться от измерения в другой проекции (зоне). Однако вряд ли кто нынче измеряет по бумажным картам. Если вас именно это напрягает, то публикуйте ваши данные действительно по зонам, или даже подберите с помощью картографов идеальную проекцию для ваших целей, например, для "косого" трубопровода это может быть Oblique Mercator - так делали в свое время. Никакого отношения к "хранению" эта проекция публикации не имеет, алгоритмы перепроецирования в ГИС нынче достаточно адекватные, можно гонять туда-обратно без потери точности. Однако смысла для мелкомасштабных ГИС-материалов в этом особого нету. Ведь ошибки (точнее, различия) за выбор зон, составляют доли процента, это где-то обсуждалось уже, найду ссылку если интересно.
Реальные несоответствия координат, на мой взгляд, могут быть только за счет выбора именно СИСТЕМЫ КООРДИНАТ (т.е. датума, а не проекции!) и составят первые десятки метров. В ГИС непросто добиться адекватности методов преобразования датума (от WGS к Пулково, например, если это делать каждый день туда-обратно). Это тоже обсуждалось неоднократно, если надо, ссылки тоже есть.