насколько я себе представляю, разница в следующем:
1) в ArcGIS вы можете создать только метафайл с параметрами трансформирования. сам растр не меняется. в ERDAS кроме этого можно еще и трансформировать сам снимок.
2) в ERDAS больше вариантов интерфейса привязки