В первую очередь тщательно изучать настройку SDE и работу с версионированными данными.
Каждый редактор должен входить под СВОИМ собственным логином.
Выполнять компрессию базы при активном редактировании каждый день.
Лечить - самый надежный способ чтобы сохранить редактирование - выгрузить данные в файлы, другую схему или другой инстанс SDE. Проверить что выгрузили всё что надо. Данные грохнуть и загрузить обратно. Это чтобы не вылавливать руками всех блох в версиях и состояниях.
Также настоятельно рекомендуется скачать и установить все патчи под Вашу версию как на сервер, так и на клиентов.
