Вот это ключевая фраза:
Input feature 1 falls outside of output XYDomain
Вы пытаетесь добавить объекты, которые находятся за пределами экстента уже существующего в mdb класса пространственных объектов.
При создании нового пустого класса или набора классов объектов в mdb Вы должны определить ему пространственную привязку, которая определяет XY-домен (экстент) этого класса или набора. Если потом вы загружаете объекты в этот класс, то в него загрузятся только те которые находятся внутри этого экстента.
При первоначальной загрузке командой Feature Class To Geodatabase (Класс объектов в БГД) ArcGIS сам рассчитывает максимальный экстент всех входных шейп-файлов и создает новый класс в mdb, устанавливая этот экстент. Если Вы потом попытаетесь в него догрузить объекты за пределами экстента, то и получите это сообщение.
Переопределить XY-домен позже не удастся. Класс придется удалить и создать заново с новыми экстентами. После чего снова загрузить в него объекты.