А что собственно не дает ею пользоваться?
Merges the selected polygons with neighboring polygons with the largest shared border or the largest area
Объединяет выделенные полигоны с соседними, имеющими наибольшую общую границу или площадь.
Т.е. прилепляет маленькие полигоны к соседним большим и убирает границу между ними. Инструмент доступен только с лицензией ArcGIS-ArcINFO.