Компресс Вы и так можете выполнить. Эта операция просто упорядочит цепочки состояний всех версий и уберет устаревшие состояния. А в конце проверит версию default и перенесет все изменения объектов из дельта-таблиц этой версии в основные таблицы. Команду рекомендуется выполнять почаще если происходит интенсивное редактирование.
Естественно, если в других версиях не был выполнен пост в версию default, то объекты из этих версий просто не запишутся в базовые таблицы, а остануться в своих версиях.
Если их нужно всё-таки собрать в базовые, то существует только один способ - выполнить пост каждой версии.
Команда до версии 9.1 требовала при выполнении отключения всех коннектов, кроме SDE. В версии 9.1 выполняется в онлайне.