Существует ещё один инструмент:
Feature to Line (Data Management) (ArcInfo only)
Creates a new output line from input polygon or line features. The attributes from the Input Features are maintained in the Output Feature Class lines
А инструмент про который Вы пишите также можно использовать, но атрибуты полигона справа или слева от полученной линии нужно привязывать из таблицы исходных полигонов командой join.