я помню, в Универститете работала с АrcInfo и там в geoprocessing wizzard/clip была опция, которая позволяла выбрать как вектор так и растер. Сейчас у меня ArcView, и я могу "клипнуть" только вектор (я имею ввиду вырезать по заданному шаблону, не по прямоугольнику). Наверное, ArcView просто не имеет такой функции.
Но я Вам хочу подсказать маленький секрет. Если Вам не нужен вырезанный растер как таковой в виде shapefile, но Вам необходимо показать его на карте, то задайте сначала границу, а потом используйте функцию clip data frame. И на карте у Вас появится все или те шайпфайлы и растеры, которые Вы хотите, но как раз в пределах нужной границы.
