Проблемы могут быть, если в проекте были старые VB-програмки. Их под 9-ку нужно чуть переделать. Правда, ArcGIS честно об этом говорит и предлагает отладить. Возможно, в проекте были подключены специфические пользовательские модули (стандартные тоже редко, но внятно ругаются), которых теперь нет машине. Проект может долго открываться, если нет или изменился путь к данным (имя сервера, номер сервиса, имя базы данных) в SDE. Но рано или поздно такой проект откроется. В остальном проблем не было.