Видимо всегда имеется драйвер ОС, который позволяет рассматрвать USB, к которому подключен GPS, как COM# порт...Тогда вроде как и проблемы нет...
А чтоб напрямую в перечне кроме COM и USB участововали - так в ArcPAd такого пока не видел (к слову на скоростях съема и передачи данных коодинат, на которых GPS реально применимы USB - это ведь тот же COM)...