rrd-файл содержит в себе пирамиду (набор уменьшенных копий изображения, используемых преимущественно для быстрого отображения на экране растра). Он является дополнительным и необязательным. aux-файл хранит информацию о привязке и другие сведения и также дополняет растровый файл, если тот находится в формате, не являющемся родным для программы (в родном формате и пирамида, и привязка, и много чего еще в различных случаях могут храниться как внешние файлы, так и внутри). Таким образом, если вы выполняете трансформирование и выходной файл в формате, например, TIFF, информация о привязке может хранится в отдельном aux-файле, имеющем то же имя.
